超级细菌解码突破!研发新药露曙光
由静宜大学、清华大学联合台大医院新竹分院团队、元培科技大学与慈济大学组成的台湾AB团队,为了解细菌抗药的原因,进而能找到治疗的方法,历经3年成功将不动杆菌中的一个流行菌株TYTH-1解码,今101年9月22日拿到美国国家医学图书馆生物技术信息中心审核号码,成为AB基因体为全世界的第11 条,亚洲地区的第5条,AB 基因体串行亦已于10月3日全球公开。
元培科技大学刘明丽教授与其超级细菌TYTH。(图片/取材自教育部电子报)
TYTH-1 菌株曾经在2008 年于台大医院新竹分院造成菌血症使病人死亡,为了解答细菌有多重抗生素抗药性与造成病患死亡的原因,台大分院郭汉岳医师与林明锋医师结合感染控制小组与检验科细菌组团队成员从2005 年开始收集菌株,从临床数据的收集到细菌身分的鉴定,建立了整套细菌分析的流程。
为了要更进一步分析细菌的特性,在当时仍然是台大医院的前身-行政院卫生署新竹医院时代,在资源非常有限的情况下,郭医师团队成员于2007年结合了元培科技大学刘明丽教授的团队来做更进一步的菌源分析。
台湾AB团队对超级细菌遗传密码的突破,将可找出控制抗药性菌株传播的方法,甚至找出能治疗疾病的新药物。(图片提供/台大医院新竹分院)
在元培科技大学刘明丽教授的实验室里,刘教授带领着学生不断的从菌株的抗药表现型与抗药基因型去寻求细菌抗药的真实原因,所有的研究成果自2009年开始发表在美、日、英等国际性抗药领域的期刊上,特别是2009年的细菌抗药领域研究成果更是获得国际研讨会论文大奖。由于细菌的抗药过程非常的复杂,2009年刘教授请求静宜大学唐传义校长的协助,期望借由生物信息团队的协助来解答细菌抗药的机制。
台湾AB团队研究的包氏不动杆菌(AB菌)原本是环境中存在的细菌,随着现在医学的进步,病患的病情严重度跟抵抗力均较过去严重,使得这种原本对正常人影响不大的细菌开始感染病患,造成许多医院中住院的患者发生肺炎、泌尿道感染、伤口感染,甚至菌血症。包氏不动杆菌不论在台湾或是其他地区,已经成为临床治疗上值得重视的问题。
台湾AB团队这次创了2个纪录,第1,基因体拼组的完整性,卓越的信息演译技术配合生物实验室的验证技术,合作无间,使得基因体拼接完整。第2,基因体的注解数量最多,团队技术已经可以和国际其他的团队并驾齐驱,可以快速通过美国国家医学图书馆生物技术信息中心审核。
台大医院新竹分院感染科主任医师郭汉岳表示,有了这条基因体,代表已经拥有了非常完整的技术平台,未来可利用此平台技术,来解开其他的物种的基因密码之外,可以利用这些基因信息来寻找细菌产生抗药性的机制,并且进一步找出控制抗药性菌株传播的方法,甚至找出能治疗疾病的新药物。
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